Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6ka4Q9Z2B9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rps6ka4Q9Z2B9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms