Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccne2Q9Z238 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccne2Q9Z238 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccne2Q9Z238 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms