Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Padi4Q9Z183 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Padi4Q9Z183 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Padi4Q9Z183 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi4Q9Z183 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms