Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr1h3Q9Z0Y9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nr1h3Q9Z0Y9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1h3Q9Z0Y9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms