Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd6ipQ9WU78 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd6ipQ9WU78 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcd6ipQ9WU78 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcd6ipQ9WU78 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcd6ipQ9WU78 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcd6ipQ9WU78 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcd6ipQ9WU78 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd6ipQ9WU78 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd6ipQ9WU78 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms