Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6cQ9WTM3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema6cQ9WTM3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms