Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod2Q9R0B9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod2Q9R0B9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod2Q9R0B9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms