Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn8Q9QZ49 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn8Q9QZ49 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn8Q9QZ49 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn8Q9QZ49 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms