Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SpastQ9QYY8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpastQ9QYY8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpastQ9QYY8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.4 ms