Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnckQ9QYK9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnckQ9QYK9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnckQ9QYK9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms