Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai3Q9QY31 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai3Q9QY31 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms