Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copg2Q9QXK3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg2Q9QXK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg2Q9QXK3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms