Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUR6

Prep, Prolyl endopeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrepQ9QUR6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrepQ9QUR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrepQ9QUR6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms