Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms