Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn6Q9JMB8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cntn6Q9JMB8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntn6Q9JMB8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms