Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk1Q9JLM8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclk1Q9JLM8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dclk1Q9JLM8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms