Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr5Q9JLF7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tlr5Q9JLF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tlr5Q9JLF7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms