Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rcan3Q9JKK0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rcan3Q9JKK0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rcan3Q9JKK0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rcan3Q9JKK0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rcan3Q9JKK0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rcan3Q9JKK0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms