Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Alyref2Q9JJW6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Alyref2Q9JJW6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Alyref2Q9JJW6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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