Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scube2Q9JJS0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scube2Q9JJS0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scube2Q9JJS0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube2Q9JJS0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms