Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn19Q9ET38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn19Q9ET38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms