Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndst4Q9EQW8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndst4Q9EQW8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndst4Q9EQW8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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Ndst4Q9EQW8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndst4Q9EQW8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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Ndst4Q9EQW8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndst4Q9EQW8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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Ndst4Q9EQW8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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Ndst4Q9EQW8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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Ndst4Q9EQW8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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Ndst4Q9EQW8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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Ndst4Q9EQW8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
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Ndst4Q9EQW8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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Ndst4Q9EQW8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndst4Q9EQW8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndst4Q9EQW8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndst4Q9EQW8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndst4Q9EQW8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndst4Q9EQW8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndst4Q9EQW8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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