Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx6Q9DBY5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cbx6Q9DBY5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cbx6Q9DBY5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cbx6Q9DBY5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cbx6Q9DBY5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cbx6Q9DBY5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms