Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp27a1Q9DBG1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp27a1Q9DBG1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp27a1Q9DBG1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms