Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rsph3bQ9DA80 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rsph3bQ9DA80 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph3bQ9DA80 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms