Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgf29Q9DA08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sgf29Q9DA08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms