Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Alkbh4Q9D8F1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alkbh4Q9D8F1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Alkbh4Q9D8F1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Alkbh4Q9D8F1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms