Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyp2c55Q9D816 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c55Q9D816 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2c55Q9D816 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms