Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D7E4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D7E4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D7E4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D7E4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D7E4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms