Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl40Q9D783 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl40Q9D783 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl40Q9D783 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms