Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nsmce1Q9D720 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce1Q9D720 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce1Q9D720 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms