Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hrct1Q9D6B9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hrct1Q9D6B9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms