Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdr42e1Q9D665 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdr42e1Q9D665 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdr42e1Q9D665 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdr42e1Q9D665 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdr42e1Q9D665 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdr42e1Q9D665 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr42e1Q9D665 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms