Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab11fip1Q9D620 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab11fip1Q9D620 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab11fip1Q9D620 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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