Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrp2bpQ9D4C6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrp2bpQ9D4C6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms