Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D1K7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D1K7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D1K7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D1K7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D1K7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D1K7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D1K7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D1K7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D1K7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D1K7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D1K7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D1K7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms