Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610524H06RikQ9CZU9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610524H06RikQ9CZU9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms