Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhl35Q9CZ49 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl35Q9CZ49 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl35Q9CZ49 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms