Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXX9

Cuedc2, CUE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cuedc2Q9CXX9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cuedc2Q9CXX9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cuedc2Q9CXX9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cuedc2Q9CXX9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cuedc2Q9CXX9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms