Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx10Q9CWT3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx10Q9CWT3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx10Q9CWT3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms