Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Gm26657Q9CVR1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Gm26657Q9CVR1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm26657Q9CVR1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Gm26657Q9CVR1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Gm26657Q9CVR1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Gm26657Q9CVR1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Gm26657Q9CVR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Gm26657Q9CVR1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Gm26657Q9CVR1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Gm26657Q9CVR1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm26657Q9CVR1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Gm26657Q9CVR1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm26657Q9CVR1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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