Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d3Q9CSV6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d3Q9CSV6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d3Q9CSV6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms