Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspo2Q9CRZ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspo2Q9CRZ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspo2Q9CRZ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms