Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd1Q9CR42 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd1Q9CR42 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ankrd1Q9CR42 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ankrd1Q9CR42 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd1Q9CR42 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ankrd1Q9CR42 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms