Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rer1Q9CQU3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rer1Q9CQU3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms