Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nipsnap3bQ9CQE1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms