Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpd52l3Q9CQ14 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpd52l3Q9CQ14 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpd52l3Q9CQ14 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpd52l3Q9CQ14 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms