Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2a1Q99PM3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2a1Q99PM3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2a1Q99PM3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms