Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2ird2Q99NI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird2Q99NI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms