Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc12a9Q99MR3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc12a9Q99MR3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc12a9Q99MR3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc12a9Q99MR3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a9Q99MR3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a9Q99MR3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a9Q99MR3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms